电磁流量计在现场使用中可能出现各种故障，这些故障归纳起来为两个方面的原因，其一为电磁流量计及关联设备不正常引起的，主要包括转换器的原因和传感器的原因，这类原因引起的故障一般比较容易解决；其二为非电磁流量计引起的原因，主要包括参数设置不当，因安装不合理导致介质特性引起的，等电势接地不可靠，外界电磁波干扰、管路杂散电流干扰等。对于诸如此类的故障，除了要熟悉该仪表性能以外，还要求维修工程师具有广博的知识和丰富的现场经验，需要进行推理分析，更需要使用单位和制造厂密切配合，多方试验。有些时候受限于条件，可能要数月或数年才能真正找到原因。

电磁流量计的故障主要表现有：（1）输出晃动；（2）流量测量与应用参比值不相符（测量值与用户的工艺参数不相符）；（3）无流量信号输出；（4）输出信号超过满度值。

通常故障的检查程序，从显示仪表工作是否正常开始，逆流量信号传送方向进行。常规的检查一般先用模拟信号器测试转换器，以判断故障发生在转换器及其后续仪器还是在连接电缆和传感器发生的。若是转换器的故障，由于现在的转换器大部分都有互换性，就可方便地试调换转换器部件甚至转换器整机；若是传感器的故障需要试调换时必须停止管道系统运行，因涉及面广往往不容易实施，尤其是大口径的电磁流量计。